净化工程主要做的工作包括以下几个方面：

净化室建筑设计：是净化工程的基础，包括净化室的平面布置、空间布局、围护结构设计等。

暖通工程：是净化工程的重要组成部分，包括净化室的温度、湿度、压力、气流速度与气流分布等控制。

净化工艺：是净化工程的核心，包括空气净化、水净化、表面净化等。空气净化主要是通过过滤、静电吸附等技术去除空气中的颗粒物和微生物。

净化设备的安装：包括空气过滤器、风机、净化工作台、传递窗等。

自控系统安装：是净化工程的智能化控制系统，包括净化室的温湿度、压力、气流速度与气流分布等参数的自动控制系统的安装。

净化工程可以应用于医疗、制药、电子、食品等行业，主要目的是去除空间内空气中的各种污染物，使产品能够在良好的环境空间中生产制造。